教研系列

刘启昆

邮箱:qikunliu@pku.edu.cn

简介

个人简介

研究员、博士生导师、博雅青年学者。

 

教育经历

刘启昆于2008年获得复旦大学学士学位,2014年获得美国宾夕法尼亚州立大学博士学位,2014年9月至2019年6月在美国加利福尼亚大学洛杉矶分校开展博士后研究,2019年7月回国,任职于澳门新葡萄娱乐9455。

 

研究方向

实验室主要从事植物表观遗传学领域相关的研究工作。DNA的甲基化修饰是植物调控基因表达的重要机制。通常情况下,基因和转座子的表达活性受到DNA甲基化的强烈抑制。然而,在特定的遗传背景和环境胁迫下,带有甲基化修饰的基因会逃脱监控产生转录活性。我们对基因和转座子如何逃脱DNA甲基化的抑制效应极为感兴趣。结合基因组学,遗传学和细胞生物学的手段,我们希望能进一步阐明此现象的分子机制和生物学意义。

 

代表性成果

1. Chen M, Liu Q, Gao S, Jacobsen SE, Tang Y. Genome mining and biosynthesis of a polyketide from a biofertilizer fungus that can facilitate reductive iron assimilation in plant. Proc Natl Acad Sci U.S.A.  2019; DOI:10.1073/pnas.1819998116.

2. Yan Y, Liu Q, Jacobsen SE, Tang Y. The impact and prospect of nature product discovery in agriculture. EMBO Rep.  2018; DOI:10.15252/embr.201846824.

3. Yan Y*, Liu Q*, Zang X*, Yuan S, Bat-Erdene U, Nguyen C, Gan J, Zhou J, Jacobsen SE, Tang Y. Harnessing a fungal dihydroxy-acid dehydratase inhibitor as a herbicide with a novel mode of action. Nature. 2018;559(7714):415-418. *co-first author 

4. Zhang Y*, Harris CJ*, Liu Q*, Liu W, Ausin I, Long Y, Xiao L, et al. Large-scale comparative epigenomics reveals hierarchical regulation of non-CG methylation in Arabidopsis. Proc Natl Acad Sci U.S.A.  2018;115(5):E1069-E74. *co-first author

5. Coruh C, Cho SH, Shahid S, Liu Q, Wierzbicki A, Axtell MJ. Comprehensive Annotation of Physcomitrella patens Small RNA Loci Reveals That the Heterochromatic Short Interfering RNA Pathway Is Largely Conserved in Land Plants. Plant Cell . 2015;27(8):2148-62.

6. Liu Q, Axtell MJ. Quantitating plant microRNA-mediated target repression using a dual-luciferase transient expression system. Methods Mol Biol . 2015;1284:287-303.

7. Brousse C, Liu Q, Beauclair L, Deremetz A, Axtell MJ, Bouche N. A non-canonical plant microRNA target site. Nucleic Acids Res . 2014;42(8):5270-9.

8. Liu Q, Wang F, Axtell MJ. Analysis of complementarity requirements for plant microRNA targeting using a Nicotiana benthamiana quantitative transient assay. Plant Cell . 2014;26(2):741-53.

Baidu
sogou